پیوندهای مفید
آمار
| تعداد نشریات | 21 |
| تعداد شماره‌ها | 632 |
| تعداد مقالات | 9,260 |
| تعداد مشاهده مقاله | 67,743,699 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 8,157,620 |
مطالعه برهمکنش های مشتقات کوئینازولون با ساختار G-quadruplex DNA به عنوان یکی از استراتژی های نوین ضد سرطان با استفاده از روش های محاسباتی | ||
| شیمى کاربردى روز | ||
| مقاله 14، دوره 10، شماره 36، آذر 1394، صفحه 177-186 اصل مقاله (776.31 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22075/chem.2015.2816 | ||
| نویسندگان | ||
| کیانا غلامجانی مقدم؛ مجید هاشمیان زاده* | ||
| دانشگاه علم و صنعت ایران | ||
| تاریخ دریافت: 13 فروردین 1394، تاریخ بازنگری: 22 خرداد 1394، تاریخ پذیرش: 23 مرداد 1394 | ||
| چکیده | ||
| در سال های اخیر پایدار کردن ساختارهای G-quadruplex به عنوان یک هدف در درمان سرطان توجه زیادی را به خود جلب کرده است. مشتقات کوئینازولون (QD) از دسته لیگاندهایی هستند که جهت پایدار کردن این ساختارها طراحی و سنتز شده اند. درک ماهیت برهمکنش بین این لیگاندها و ساختار G-quadruplex از اهمیت بسیار بالایی برخوردار است. جهت بررسی دقیق تر اینکه چگونه این برهمکنش ها با تغییر ساختار لیگاند تحت تأثیر قرار می گیرند، برهمکنش های بین دو مشتق کوئینازولون (QD1 و QD2) و ساختار G-quadruplex با استفاده از روش های داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه و بررسی قرار گرفت. مطالعات نشان داد که لیگاندQD1 با زنجیره آلکیلی کوتاهتر برهمکنش های قویتری نسبت به لیگاند QD2 دارد. در واقع کوتاهتر کردن طول زنجیره این مشتقات نقش بسیار مهمی در تشکیل پیوندهای هیدروژنی و برهمکنش های الکتروستاتیک با گروه فسفات چهارچوب G-quadruplexایفا می کند که به طور تجربی اطلاعاتی درباره این برهمکنش ها بدست نیامده است. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| G-quadruplex؛ کوئینازولون؛ داکینگ مولکولی؛ شبیه سازی دینامیک مولکولی؛ انرژی آزاد | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Computational studies of the interactions between quinazolone derivatives and G-quadruplex DNA as an anticancer strategy | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Kiana Gholamjani Moghaddam؛ Majid Hashemianzadeh | ||
| چکیده [English] | ||
| In recent years, stabilization of G-quadruplex structures with small molecules has attracted considerable attentions as a promising target for cancer therapy. Quinazolone derivatives (QD) are among the most important classes of ligands that is designed and synthesized to stabilize G-quadruplex structures. Understanding the nature of interactions between the ligands and G-quadruplex is of great importance. To precisely investigate how these interactions can be influenced by structural variation of the ligand, binding interactions of two quinazolone derivatives (QD1 and QD2) with G-quadruplex were studied by molecular docking and molecular dynamics simulation. The results revealed that ligand QD1 has stronger interactions with G-quadruplex than QD2. In fact, side chain shortening of these derivatives play a crucial role in hydrogen bond formation and electrostatic interactions with the phosphate backbone of G-quadruplex which is not obtained experimentally. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| G-quadruplex, Quinazolone, Molecular docking, Molecular dynamics simulation, Free energy | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 571 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 565 |
||