پیوندهای مفید
آمار
| تعداد نشریات | 21 |
| تعداد شمارهها | 697 |
| تعداد مقالات | 10,088 |
| تعداد مشاهده مقاله | 71,228,442 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 62,957,812 |
سنتز دی پپتیدهای جدید بر پایه اوراسیل و تیمین و بررسی داکینگ مولکولی این ترکیبات بعنوان مهار کننده سیستم کوئوروم سنسینگ در سودوموناس آئروژینوزا | ||
| شیمى کاربردى روز | ||
| مقاله 41، دوره 14، شماره 50، فروردین 1398، صفحه 277-290 اصل مقاله (1.42 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22075/chem.2018.13316.1299 | ||
| نویسندگان | ||
| اعظم حیدری1؛ نازیلا ولی خانی فرد2؛ نادر نوشیران زاده* 3؛ رحمان بیکس4 | ||
| 1دانشگاه علوم پزشکی زنجان | ||
| 2گروه شیمی، دانشکده علوم، دانشگاه زنجان، زنجان | ||
| 3گروه شیمی، دانشکده علوم دانشگاه زنجان، زنجان، ایران | ||
| 4گروه شیمی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه بین المللی امام خمینی(ره)، قزوین، ایران | ||
| تاریخ دریافت: 25 آذر 1396، تاریخ بازنگری: 26 فروردین 1397، تاریخ پذیرش: 01 مهر 1397 | ||
| چکیده | ||
| در مطالعه حاضر با توجه به اهمیت ترکیبات دی پپتیدی در تشخیص بیماری یا بعنوان ترکیبات دارویی، ترکیبات دیپپتیدی جدیدی با استفاده از مشتقات پیریمیدینی تیمین و اوراسیل سنتز شد. واکنش متیل 2-(5-متیل-2،4-دی اکسو-4،3-دی هیدرو پیریمیدین-1(2H)-ایل)استات و متیل 2-2،4-دی اکسو-4،3-دی هیدرو پیریمیدین-1(2H)-ایل)استات با مشتقات دی آمین، منجر به تولید مشتقات دی پپتید با بازده کاملاً خوبی گردید. سپس با استفاده از طراحی محاسباتی دارو به روش داکینگ مولکولی، اثر مهار کنندگی ترکیبات سنتزی بر پروتئین تنظیم کننده LasR تحت کنترل سیستم کوئوروم سنسینگ در باکتری سودوموناس آئروژینوزا، که نقش مهمی در تنظیم بیان ژنهای بیماریزایی در باکتریها دارد، بررسی شد. نتایج مطالعه نشان داد که ترکیبات سنتزی اثر مهار کنندگی قابل ملاحظهای بر پروتئین LasRدارند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| دیپپتید؛ سنتز؛ تیمین؛ اوراسیل؛ داکینگ مولکولی؛ کوئوروم سنسینگ | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Synthesis of new dipeptides based on uracil and thymine and investigation of the molecular docking of these compounds as inhibitors of quorum sensing system in Pseudomonas aeruginosa | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Azam Heidari1؛ Nazila Valikhani fard2؛ Nader Noshiranzadeh3؛ Rahman Bikas4 | ||
| 1zanjan university of medical sciences | ||
| 2Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Zanjan | ||
| 3Department o chemistry, faculty of science, university of zanjan | ||
| 4Department of chemistry , faculty of basic science, Imam Khomeini International University | ||
| چکیده [English] | ||
| In this study, due to the importance of dipeptide compounds in diagnosis of disease or as drug compounds, new dipeptide compounds were synthesized using pyrimidine derivatives of thymine and uracil. The reaction of Methyl 2- (5-methyl-2,4-dioxo-4,3-dihydropyrimidine-1 (2 H) -yl) acetate and methyl 2-2,4-dioxo-4,3-dihydropyrimidine -1 (2H) -Il) acetate with diamine derivatives lead to the production of dipeptide derivatives in good yield. Then, using the computational design of the drug by the molecular docking method, the inhibitory effect of synthetic compounds on the LasR regulatory protein of Pseudomonas aeruginosa quorum sensing system, which plays an important role in regulating the expression of pathogenic genes in bacteria, were investigated. The results of the study showed that synthetic compounds have a significant inhibitory effect on the LasR protein. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| dipeptide, Synthesis, thymine, uracil, Molecular docking, quorum sensing | ||
| مراجع | ||
|
[1] V. A. Kataev, I. N. Tyurenkov, S. A. Meshcheryakova, V. N. Perfilova, D. A. Munasipova and D. D. Borodin, Pharm. Chem. J., 48 (2014) 16. [2] M. Dabiri, H. Arvin-Nezhad, H. R. Khavasi and A. Bazgir, Tetrahedron, 63 (2007) 1770. [3] V. Malik, P. Singh and S. Kumar, Tetrahedron, 61 (2005) 4009. [4] B. Banerji, S. K. Pramanik, U. Pal and N. C. Maiti, Chem. Cent. J, 7 (2013) 91. [5] T. Defoirdt, N. Boon and P. Bossier, PLoS pathog., 6 (2010) e1000989. [6] I. A. Khmel and A. Z. Metlitskaya, Inst. Mol. Gen., 2 (2006) 195. [7] T. R. De Kievit and B. H. Iglewski, Infect. Immun., 68 (2000) 4839. [8] L. C. M. Antunes, R. B. Ferreira, M. M. Buckner and B. B. Finlay. Microbiology, 156 (2010) 2271. [9] D. Kadhim and M. R. Ali, Int. J. Curr. Microbiol. Appl. Sci., 3 (2014) 204. [10] C. D. Sifri, Clin. Infect. Dis., 47 (2008) 1070. [11] E. Déziel, F. Lépine, S. Milot, J. He, M. N. Mindrinos, R. G. Tompkinis and L. G. Rahme, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 101 (2004) 1339. [12] H. S. Kim, S. H. Lee, Y. Byun, and H. D. Park, Sci. Rep., 5 (2015) 8656. [13] L. Kumar, S. Chhibber, R. Kumar and K. Harjai, Fitoterapia, 102 (2015) 84. [14] H. Wu, Z. Song, M. Hentzer, J. B. Andersen, S. Molin, M. Givskov, and N. Høiby, J. Antimicrob. Chemother., 53 (2004) 1054. [15] S. A. El-Mowafy, M. I. Shaaban, K. H. A. El-Galil, J. Appl. Microbiol., 177 (2014) 1388. [16] A. Heidari, N. Noshiranzadeh, F. Haghi and R. Bikas, Microb. Pathog., 112 (2017) 103. [17] K. Saurav, C. Valeria, V. Venturi and L. Steindler, Marine Drugs, 15 (2017) 53. [18] C.Y. Loo, R. Rohanizadeh, P.M. Young, D. Traini, R. Cavaliere, C. B. Whitchurch, and W. H. Lee. J. Agric. Food. Chem., 64(2016) 2513. [19] P. Tyagi, M. Singh, H. Kumari, and K. Mukhopadhyay, PloS one, 10 (2015) e0121313. [20] M. Sabbah, F. Fontaine, L. Grand, M. Boukraa, M.L. Efrit, A. Doutheau, L. Soulere and Y. Queneau, Bioorg. Med. Chem., 20 (2012) 4727. [21] M. R. Hansen, T. H. Jakobsen, C. G. Bang, A. E. Cohrt, C. L. Hansen, J. W. Clausen, S. T. Le Quement, T.Tolker-Nielsen, M. Givskov and T. E. Nielsen. Bioorganic and Medicinal Chemistry, 23 (2015), 1638. [22] S. Reverchon, B. Chantegrel and C. Deshayes, Bioorg. Med. Chem. Let., 12 (2002) 1153. [23] W.K. Goh, C. R. Gardner and K. V. G. Chandra Sekhar, Bioorg. Med. Chem, 23 (2015), 7366. [24] A. Bucio-Cano, A. Reyes-Arellano, J. Correa-Basurto, M. Bello, J. Torres-Jaramillo, H. Salgado-Zamora, E. Curiel-Quesada, J. Peralta-Cruz, Bioorg. Med. Chem., 23 (2015) 7565. [25] J. N. Capilato, S. V. Philippi, T. Reardon, A. McConnell, D. C. Oliver, A. Warren, J S. Adams, C. Wu, L. J. Perez, Bioorg. Med. Chem., 25 (2017) 153. [26] M. Allert, S.S. Rizk, L.L. Looger, and H.W Hellinga, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A, USA. 101 (2004) 7907. [27] B. Kramer, M. Rarey and T. Lengauer, Proteins: Structure, Function and Genetics. 37 (1999) 228. [28] G. Khodarahmi, P. Asadi, H. Farrokhpour, F. Hassanzadeh, M. Dinari, RSC. Adv., 5 (2015) 58064. [29] غلامجانی مقدم، کیانا; هاشمیان زاده، سید مجید، مجله شیمی کاربردی، شماره 36 (1394) صفحه 177. [30] د. یانگ، طراحی محاسباتی دارو؛ ترجمه رسول امینی، سارا، دباغ، فاطمه، وثوق، فراز، چاپ اول، انتشارات جامعه نگر، تهران، 1391. [31] P. Asadi, G. Khodarahmi, A.J. Najafabadi, L. Saghaei, F. Hassanzadeh, Iran. J. Basic. Med. Sci., 20 (2017) 975. [32] P. Asadi, G. Khodarahmi, H. Farrokhpour, F. Hassanzadeh, L. Saghaei, Res. Pharm. Sci., 12 (2017) 233. [33] M. Dinari, F. Gharahi, P. Asadi, J. Mol. Struct., 1156 (2018) 43. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,322 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 931 |
||